Время Past Perfect  описывает действие, которое произошло раньше другого действия или определенного момента в прошлом.

Утвердительное предложение во времени Past Perfect образуется при помощи  вспомогательного глагола had и V3/Ved (третьей формы глагола для неправильных глаголов или глагола с окончанием –ed для правильных).
В разговорной речи используется краткая форма вспомогательного глагола had=‘d.

Другое действие в прошлом обычно представлено глаголом во времени Past Simple.
Время Past Perfect часто используется с when, before, by, after, earlier, first.
When he arrived at the airport the plane had taken off. (Когда он приехал в аэропорт, самолёт уже улетел.)
He had been an actor before he became the President. (Он был актёром до того, как стал президентом.)
As soon as I had known, I called you. (Как только я узнала, я позвонила тебе.)

Использование Past Perfect, говорит не только о том, что одно действие было раньше другого, оно также указывает на причину из-за которой произошло другое действие. Past Perfect не используется в речи самостоятельно, даже если представлено в отдельном предложении, оно связано с другим действием в прошлом.
They were not at home. They had gone to the cinema. (Их не было дома.Они ушли в кино.) Второе предложение They had gone to the cinema. (Они ушли в кино.) является причиной первого.
The team lost because they had gone to the bar before the match. (Команда проиграла, потому что они ходили в бар перед матчем.)
Anna didn’t buy this dress as she had lost her credit card. (Анна не купила это платье потому, что потеряла свою кредитную карту.)

В отрицательном предложении в Past Perfect после вспомогательного глагола  had следует частица not, и далее  V3/Ved.
The director was very angry when he came. She had not finished the annual report.(Директор очень разозлился, когда он приехал. Она не закончила годовой отчёт.)
Past Perfect во втором предложении объясняет причину, почему разозлился директор: она не закончила годовой отчёт до того, как он приехал.

В разговорной форме обычно используются сокращенная форма
had not=hadn’t.
I got up late because I hadn’t set the alarm. (Я проспал потому, что не завел будильник.)
They hadn’t invited her so she didn’t come to the party. (Они её не пригласили, поэтому она не пришла на вечеринку.)

В вопросительном предложении в Past Perfect используется обратный порядок слов,  вспомогательный глагол had стоит перед местоимением/ существительным, за которым следует V3/Ved.
Had you studied any English before your started at this school? (Ты изучал английский до того, как поступил в эту школу?)
Had you met any English people before you came to England? (Ты встречал англичан раньше, до того, как ты приехал в Англию?)
Why hadn’t you called me before you left? (Почему ты не позвонил мне перед тем, как ушёл?)

Краткий ответ
Yes, I had./ Yes, he had. (Да.) No, I hadn’t./No, he hadn’t. (Нет.)